GGZ inGeest is een stichting met een raad van bestuur die bestaat uit:
mw. S.T. van Lonkhuijzen-Hoekstra, MBA MCM, voorzitter raad van bestuur
dhr. drs. M.P.O. Stoop, lid raad van bestuur
dhr. prof. dr. A.T.F. Beekman, lid raad van bestuur
De raad van bestuur werkt volgens het collegiaal model en besluitvorming vindt plaats op basis van consensus. Hij is bestuurlijk verantwoordelijk voor de instelling en geeft direct leiding aan de directies van de circuits en de diensthoofden. De verantwoordelijkheid voor de kwaliteit van de zorg en de uitvoering van de Wet Bijzondere opnemingen in psychiatrische ziekenhuizen (Wet Bopz) is gedelegeerd aan de geneesheer-directeur mevrouw Gijsbers - van Wijk. De raad van toezicht houdt toezicht op het beleid van GGZ inGeest.
De raad van bestuur GGZ inGeest vormt samen met de raad van bestuur VU medisch centrum het Algemeen Bestuur van GGZ inGeest.
Zorgcircuits
De hulpverlening en activiteiten van GGZ inGeest worden geboden vanuit veertien circuits . Deze circuits werken regionaal en/of voor bepaalde leeftijdsgroepen: kinderen en jongeren, volwassenen en ouderen. Wetenschappelijk onderzoek bij GGZ inGeest vindt plaats vanuit de dienst onderzoek.